Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o distrito de São João do Pacuí figura no município de Coração de Jesus. 
 Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1993. 
 Elevado à categoria de município com a denominação de São João do Pacuí, pela lei estadual nº 10703, de 21-12-1995, desmembrado de Coração de Jesus. Sede no antigo distrito de São João do Pacuí. Constituído de 2 distritos: São João do Pacuí e Santa da Pedra. Criado pela referida lei acima citada. Instalado em 01-01-1997. 
 Em divisão territorial datada de 2001, o município é constituído de 2 distritos: São João do Pacuí e Santa da Pedra. 
 Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2007. 
 Fonte: IBGE