Formação Administrativa
O distrito de São João tornou-se autônomo, sendo erigido a categoria de vila conforme a lei n° 1.255, de 28-12-1868.
A lei n° 1.402, de 22-07-1871, revogou a lei anterior, passando a então vila de São João à condição de distrito do município de Limoeiro, já que a sede da vila foi transferida para Limoeiro.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1933, o distrito de São João figura no município de Limoeiro.
Assim permanecendo em divisões territoriais datadas de 31-12-1936 e 31-12-1937.
Pelo decreto estadual nº 169, de 31-03-1938, retificado pelo decreto estadual nº 378, de 20-10-1938, o distrito de São João passou a denominar-se São João do Jaguaribe.
Pelo decreto estadual nº 448, de 20-12-1938, o distrito de São João do Jaguaribe volta a denominar-se São João.
No quadro fixado para vigorar no período de 1939-1943, o distrito já denominado São João, figura no município de Limoeiro.
Pelo decreto-lei estadual nº 1.114, de 30-12-1943, o distrito de São João passou a denominar-se Jandoim e o município de Limoeiro a denominar-se Limoeiro do Norte.
Em divisão territorial datada de 01-07-1950, o distrito de Jandoim ex-São João figura no município de Limoeiro do Norte ex-Limoeiro.
Pela lei estadual nº 1.153, de 22-11-1951, o distrito de Jandoim passou a denominar-se São João do Jaguaribe.
Em divisão territorial datada de 01-07-1955, o distrito de São João do Jaguaribe ex-São João, figura no município de Limoeiro do Norte ex-Limoeiro.
Elevado à categoria de município com a denominação de São João do Jaguaribe, pela lei estadual nº 3.813, de 13-09-1957, desmembrado de Limoeiro do Norte. Sede no antigo distrito de São João do Jaguaribe. Constituído do distrito sede. Instalado em 25-03-1959.
Em divisão territorial datada de 01-07-1960, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2005
Alterações toponímicas distritais
São João para São João do Jaguaribe alterado, pelo decreto-lei estadual nº 169, de 31-03-1938, retificado pelo decreto estadual nº 378, de 20-10-1938.São João do Jaguaribe para São João, alterado pelo decreto estadual nº 448, de 20-12-1938.Pela lei estadual nº 1.114, de 30-12-1943 ,Jandoim para são João do Jaguaribe alterado, pela lei estadual nº 1153, de 22-11-1951.
Fonte: IBGE - Enciclopédia dos Municípios Brasileiros Sampaio Filho, Dorian História dos Municípios do Ceará; Fortaleza; RBS Editora, 2003. FALCÂO,Marlio Fábio Pelosi Ciará Terra do Sol: Genealogia e Toponímia dos Municípios Cearenses.Fortaleza,1999.